방귀의 냄새와 빈도는 섭취한 음식물의 종류와 양에 의존하지만, 방귀가 지나치게 잦거나 냄새가 심하다고 느껴진다면, 건강에 적신호가 발생했을 가능성이 높다. 전문가들이 입을 모아 말하는 '건강한 방귀'는 소리와 냄새가 적은 방귀다. 유독 지독한 냄새와 많은 양의 가스를 배출했다면, 과식 또는 비만을 의심해보아야 한다. 또한 피로와 스트레스가 누적되면, 위나 장과 같은 소화기관이 소화 기능을 다하지 못해 장내 균의 균형이 깨져 나쁜 균이 증식하고, 이어 냄새가 안 좋은 방귀를 생성한다. 그 밖에는 과민성 대장염과 같은 대장질환을 앓고 있을 가능성이 있거나, 최근 갑자기 방귀 횟수가 늘어난 경우라면 급성 장염, 혹은 세균성 장염을 의심해 보아야 한다.