동의보감에는 식초가 종기와 종양을 없애고 어지럼증을 치료한다는 등의 효능이 기록되어 있으며, 서양 의학의 선구자 히포크라테스는 2천여 년 전부터 식초를 사용해 상처를 치료했다고 알려진다. 실제로 식초는 박테리아를 포함한 병원균을 죽이는 데 도움을 줄 수 있다.
또한, 사과식초는 혈당을 낮추는 데도 도움을 준다. 제2형 당뇨병 환자를 대상으로 한 연구에서는 잠자기 전 사과식초 두 스푼을 먹은 사람은 다음 날 아침 혈당 수치가 4~6% 낮아진 것으로 나타났다.
일본의 한 연구에서는 사과식초를 매일 15~30mL씩 12주 동안 섭취한 그룹은 위약을 먹은 그룹에 비해1~2kg 감소했으며 내장지방수치, 콜레스테롤, 중성지방, 식욕점수 또한 유의하게 줄었다는 결과가 나타나기도 했다. 이 외에도 사과식초는 심혈관질환, 다낭성난소증후군, 코막힘 등에 긍정적인 영향을 준다고 알려진다.