그러나 나폴레옹의 몰락과 함께, 모나리자는 파리에있는 루브르 박물관에 보관되어지게 된다. 루브르 박물관에 장식되게 된 모나리자는, 아직 "르네상스 시대의 미술 작품 중 하나"라는 존재에 불과했다.
그러나 1911년에 일어난 사건에 의해 모나리자의 운명은 돌변한다.
모나리자는 루브르 박물관에서 도난당하게 된다. 모나리자 도난 사건으로 파리는 호들갑을 떨었고, 연일 뉴스에 보도되었으며, 경찰도 대대적으로 범인 색출을 위해 노력했다.
세계에서 가장 유명한 화가 중 한 명인, 파블로 피카소도 모나리자 도난 사건의 용의자로 조사를 받았을 정도로 시끌벅적했는데, 물론 피카소는 사실 무근으로 드러났지만...